Chiapas es uno de los estados más ricos en biodiversidad del país. Sus 75 634.4 km de extensión dan cabida a varios ecosistemas que van desde bosque de pino y selva hasta llanuras costeras y esteros de agua dulce y salina.
El territorio chiapaneco es surcado por varios sistemas montañosos.
Al centro se ubica la zona de los altos que se extiende a los límites de Oaxaca; Al norte la cresta montañosa desciende lenta y boscosa desde cerca de los tres mil metros hasta casi el nivel del mar; Al oriente se halla la Selva Lacandona; Al sureste se asientan los llanos de Comitán y la región Tojolabal; el sur es dominado por los Valles Centrales, que se escalonan como terrazas y sirven de lecho al Rio Grijalva, y se continúan a los Valles de Tuxtla, de Ocozocoautla de Espinoza, La Frailesca y Cintalapa.